Men i tredje perioden avgjorde Karlskrona matchen och vann med 3-2 (0-2, 2-0, 1-0).
Segermålet för Karlskrona stod Robin Eskelinen för med bara en sekunder kvar av matchen.
Linköping startade matchen bäst och ryckte åt sig ledningen med 2-0 genom två snabba mål tidigt i perioden av Jonathan Özdemir och Sebastian Dahlqvist. Efter 2.50 i andra perioden nätade Oliver Heinonen, och reducerade åt Karlskrona.
Robin Eskelinen gjorde dessutom 2-2 efter 3.34 på pass av Anton Andersson och Emil Norrtorp.
Karlskrona avgjorde matchen med en sekund kvar att spela ännu en gång genom Robin Eskelinen assisterad av Filip Brander. Eskelinen fullbordade därmed Karlskronas vändning.
Det här var Linköpings tredje uddamålsförlust den här säsongen.
Karlskronas nya tabellposition är åttonde plats, medan Linköping är på sjätte plats.
I nästa omgång har Linköping Växjö borta i Vida Arena, söndag 26 november 13.00.