Efter en mållös första halvlek tog Linghem ledningen i andra halvleken och hemmalaget lyckades inte resa sig.
Stina Nilsson gjorde två och Embla Sköld ett mål för Linghem.
För Linghem gör resultatet att man nu ligger på femte plats i tabellen, medan Waria är på tionde och sista plats.
I nästa match möter Linghem Hjulsbro hemma på söndag 19 september 14.00.