Efter en mållös första halvlek var Smedby AIS starkare i andra halvlek.
Smedby AIS:s två mål gjordes av Emanuel Arvidsson och Buster Blosse, som gjorde ett mål var.
Smedby AIS ligger på nionde plats i tabellen efter matchen, medan Mjölby AI ligger på elfte plats.
Mjölby AI tar sig an Trosa Vagnhärad i nästa match hemma lördag 11 september 15.00.