2–0-målet var ett bisarrt sådant.
Samet Akaydin skulle passa hem till sin målvakt Altay Bayindir, som dock hade kommit ut från målet. Akaydin tittade inte upp innan han slog passen, som gick på insidan av Bayindir och mot målet.
Bayindir och Zeki Celik slängde sig efter bollen, men den hann rulla över mållinjen.
Det har nu gjorts hela sex självmål under mästerskapet.
Samet Akaydin blev i slutskedet av matchen utbytt med en skada.
Portugal kvalificerade
Vid 3–0-målet chockades många när Cristiano Ronaldo, som kom i ett friläge, valde att osjälviskt nog passa till Bruno Fernandes som kunde lägga in bollen i nät.
Det första målet gjordes av Bernardo Silva i 21:a minuten.
Segern innebär att Portugal nu är klar etta i grupp F efter att ha säkrat sex poäng på de två första matcherna, eftersom man kommer före Turkiet via inbördes möte om lagen skulle sluta på samma poäng.
Portugals superstjärna Cristiano Ronaldo är fortsatt mållös i mästerskapet.
Hela fem planstormare lyckades ta sig in från läktaren under matchen, samtliga sprang fram till just Ronaldo, innan vakter kunde avlägsna dem.
Dubbla avstängningar
Turkiets Abdulkerim Bardakci drog på sig ett gult kort i 25:e minuten efter en brysk tackling på Bernardo Silva. Mittbacken är därmed avstängd i Turkiets avslutande gruppspelsmatch mot Tjeckien, efter att han också fått gult kort i matchen mot Georgien.
Detsamma gäller för Portugals Rafael Leão som fick gult kort för en filmning i första halvlek. Leãos första gula kort, i matchen mot Tjeckien, var även det för filmning.
Portugal möter Georgien i sin sista gruppspelsmatch.