Segern var Linköpings sjätte på de senaste sju matcherna.
Tidigare under dagen förlorade Linköping på bortaplan mot Sollentuna med 8-12.
Resultatet betyder att båda lagen har oförändrad position i tabellen, Värtan på femte plats och Linköping i serieledning.
Lördag 5 mars 16.00 spelar Linköping hemma mot Djurgården.