Ett företag i Ydre anmälde inbrottet till polisen vid kvart i elva på måndagsförmiddagen.
Containrarna stod uppställda på en byggarbetsplats och inne i dem förvarades verktyg.
Det uppskattade värdet på det stulits är 200 000 kronor.
Polisen har inlett en utredning om stöld. I nuläget saknas misstänkt för brottet.