– Vi måste övervinna smärtan från det förflutna och gå vidare in i den nya eran, säger president Moon Jae-In.
– Med tanke på de många utmaningar vi står inför är nationell enighet och ett ödmjukt inkluderande viktigare än något annat, fortsätter han.
Moon sade att Parks försämrade hälsa, efter att ha suttit nästan fem år i fängelse, också bidrog till beslutet om benådning. Park har varit inlagd på sjukhus flera gånger i år.
Amnestin träder i kraft den 31 december, uppger justitiedepartementet.
– Jag uttrycker min djupa tacksamhet till president Moon Jae-in och de statliga myndigheterna som beslutade att bevilja amnesti trots många svårigheter, hälsar Park genom en medhjälpare, rapporterar nyhetsbyrån Yonhap.
Första kvinnan
Park, dotter till den tidigare diktatorn Park Chung-Hee, blev Sydkoreas första kvinnliga president och första president att bli avsatt.
Hon tillträdde 2013 och lyfte då fram sig själv som en omutbar politiker som skapat sin egen framgång. Knappt fyra år senare tvingades hon avgå efter det att en korruptionsskandal rullats upp.
Vanligt med fängelse
Det är inte ovanligt att sydkoreanska presidenter hamnar i fängelse efter sin tid vid makten, vanligtvis när deras politiska rivaler har flyttat in i presidentens Blå hus.
Chun Doo-Hwan och Roh Tae-Woo, tidigare armégeneraler och senare presidenter som efter att ha lämnat ämbetet avtjänade fängelsestraff för korruption och förräderi på 1990-talet, fick presidentens benådningar efter att ha avtjänat ungefär två år.
Ex-presidenten Roh Moo-Hyun tog sitt liv 2009 efter att ha förhörts angående mutanklagelser som involverade hans familj.
Lee Myung-Bak, den ende levande ex-presidenten förutom Park, avtjänar för närvarande ett fängelsestraff för korruption.