Båten var på väg mot brittiska Turks- och Caicosöarna, en resa på cirka 25 mil.
Den haitiska kustbevakningen uppger att 41 människor har räddats, varav 11 är skadade och får sjukhusvård.
Sedan i slutet av februari, när nya våldsamheter bröt ut i huvudstaden Port-au-Prince, har allt fler invånare försökt lämna landet med båtar, uppger IOM.
"Bristande möjligheter att försörja sig, ett kollapsat sjukvårdssystem, skolstängningar och en avsaknad av framtidsutsikter har tvingat många människor att överväga migration som ett sätt att överleva", skriver IOM i ett uttalande.