Det var när anstaltens personal beslutade om att genomföra en visitation i cellerna i april i år som de två små plastpåsarna hittades.
Påsarna skickades till Statens kriminaltekniska laboratorium (SKL) i Linköping som konstaterade att de innehöll 0,25 gram amfetamin.
Den dömde, en 44-årig man, har erkänt att en av plastpåsarna är hans och sagt att han inte visste att det var två påsar, men om det var två påsar, är troligen båda hans.
44-åringen står nu åtalad för ringa narkotikabrott vid Linköpings tingsrätt. Tidigare i veckan åtalades en annan intern på Skänningeanstalten för narkotikabrott.
Han ertappades med att förvara 2,34 gram cannabisharts i cellen.