Mannen omhändertogs i samband med att fartyget gick på grund och anhölls sedan under måndagen misstänkt för sjöfylleri och vårdslöshet i sjötrafik.
Överstyrmannen anhölls då han var utländsk medborgare och åklagaren ansåg att det fanns en risk att han skulle lämna landet.
Under torsdagen meddelade åklagarkammaren att mannen har accepterat ett strafföreläggande och erkänt sig skyldig till sjöfylleri samt vårdslöshet i trafik. Mannen ska ha blåst 0.38 promille vid provtagningen.
Strafföreläggandet landar på 60 dagsböter och villkorlig dom.
Polisen uppgav i måndags att mannen även var misstänkt för miljöbrott, om mannen fortfarande är misstänkt för detta är okänt i nuläget.