De tåg som påverkades var fjärrtåg på sträckan Stockholm-Malmö, pendeltågen mellan Norrköping och Mjölby/Tranås/Motala samt tåg i Bergslagen Mjölby-Motala.
Östgötatrafiken meddelade på morgonen att vissa pendeltåg var mellan 15 och 30 minuter försenade. Flera avgångar med Östgötapendeln var också inställda och Östgötatrafiken hänvisade till bussar som ersätter vissa turer.
Trafikverket uppgav senare att det urspårade fordonet kommer att bärgas under natten mot lördagen och för att få mer information måste resenärer kontakta sina tågbolag.
Östgötatrafiken uppgav senare på fredagsförmiddagen att Östgötapendeln nu åter är i bruk. De tidigare problemen kan dock göra att det uppstår mindre förseningar under dagen och kvällen, förklarade man.