De sex personerna är mellan 33 och 40 år gamla, uppger P4 Östergötland som var först med nyheten.
De åtalas för sabotage mot blåljusverksamhet. De är bland annat misstänkta för att ha kastat sten och andra föremål på poliser.
Upploppen bröt ut på skärtorsdagen efter att den danske politikern Rasmus Paludan aviserat att han skulle bränna Koranen på platsen, och blev starten på flera dagar av upplopp i flera städer. Över 60 personer har åtalats och dömts för sin medverkan i upploppen i Linköping och Norrköping.
Förra veckan kom en utredning med förslag om hur polisen kan stoppa koranbränningar om de anses äventyra Sveriges säkerhet.