Nio av de röstberättigade lade sin röst på henne, medan Ragnar Persenius fick fem röster och Christina Grenholm fyra.
Så här blev några av reaktionerna i Linköpings stift efter att resutatet offentliggjorts.
Margareta Carlenius, ledamot i Linköpings stift och kyrkoherde i Östra Ryd.
Vad säger du om valet av ny ärkebiskop?
– Roligt. Alla tre kandidaterna är bra, så ingen dålig valdes bort. Men hon är en bra person.
Vad tror du att Antje Jackelén kan bidra med?
– Jag hoppas att hon kan få folk att diskutera och engagera sig. Lite så som KG Hammar gjorde, han fick folk att diskutera trosfrågor på kafferasten. Jag tycker även att hon är intressant eftersom har lyft frågan att vetenskap och trosfrågor inte behöver vara varandras motsatser.
Vad innebär valet för Linköpings stift?
– Hon är bra på att lyfta dialogen. Jag tror hon kan bidra till en god dialog inom vårt stift.
Vad betyder det att hon är kvinna?
– Att kvinnans ställning stärks. Både bland präster och kyrkobesökare.