Det var klockan 12.42 som polisen i Linköping kontaktades av räddningtjänsten som tidigare larmats till skolan i Skäggetorp.
Inne på en skoltoalett hade någon samlat en pappershög och sedan tänt på. Branden kunde dock släckas av personal.
Polisen höll förhör med personer på skolan och har upprättat en anmälan om skadegörelse genom brand.
Ingen person har skadats vid händelsen.