Den misstänkte greps och anhölls på tisdagsförmiddagen. Insatsen gick lugnt tillväga, uppger Säpo.
– Personen är anhållen och frågan om häktning måste jag ta ställning till senast på fredag klockan 12, säger ansvarig åklagare Henrik Olin.
Brottsmisstankarna är enligt handlingar från Stockholms tingsrätt förberedelse till terroristbrott, grovt deltagandebrott i terroristorganisation, förberedelse alternativt försök till mord samt förberedelse till grovt brott mot lagen om brandfarliga och explosiva varor.
Enligt handlingarna är brottsplats "bland annat inom Stockholm stad".
Säpos presstalesperson Karl Melin säger att de i nuläget inte kan lämna några uppgifter om när brotten ska ha begåtts eller planerats att begås.
– Vi har ju arbetat med det här ärendet en längre tid och sedan bedömdes det helt enkelt utifrån att det behövdes göras en insats här och nu och då genomförde vi den insatsen, säger Karl Melin.
Ärendet rör våldsbejakande islamistisk extremism, men har ingen koppling till något annat pågående ärende, enligt Säpo.