Inre befäl i Linköping, Stefan Hagdahl, uppger att olyckan skedde vid en obevakad järnvägsövergång.
- Det har inte uppstått några personskador men flera resenärer kan ha chockats, säger han.
Hur kollisionen kunde ske är ännu oklart, men föraren av traktorn ska ha varit ute för att ploga snö, när olyckan var framme. Han uppges ha kunnat ta sig ur fordonet oskadd.
Räddningstjänsten i Linköping, som åkte på larmet tillsammans med kollegor från Västervik, hade till en början svårigheter med att lokalisera platsen.
- Lokföraren visste inte var han var.
Det är fortsatt stopp i tågtrafiken mellan Linköping och Västervik på grund av olyckshändelsen, enligt Trafikerket. Bussar ersätter tågen på sträckan.
Det finns i nuläget ingen prognos om när tågtrafiken kan komma att återupptas.
Tågtrafiken mellan Linköping och Kalmar via Rimforsa trafikeras som vanligt.